Ужо месяц у пробах, якія дастаўляюцца ў НДІ дэзінфекталогіі Расспажыўнагляду з усіх рэгіёнаў Расіі, назіраюцца аднолькавыя суадносіны штамаў «дэльта» і «амікрон». Пра гэта ў інтэрв'ю распавяла галоўны навуковы супрацоўнік НДІ дэзінфекталогіі Расспажыўнагляду, член-карэспандэнт РАН Алена Ілліна. Яна патлумачыла, чаму кіслародатэрапія спрыяе развіццю шпітальнай пнеўманіі, і ацаніла эфектыўнасць прэпаратаў ад COVID-19. - Алена Мікалаеўна, вы працуеце ў НДІ дэзінфекталогіі Расспажыўнагляду і займаецеся чытаннем геномаў каранавірусы, якія цыркулююць у дадзены момант. Колькі зараз секвенуецца узораў віруса ў тыдзень, месяц?

Таму нельга сказаць, што па Расii «iдзе хваля». Гэта, хутчэй, агульны выбліск, са ўсіх бакоў прыкладна аднолькавая. Я чакала ўбачыць нейкую розніцу паміж Масквой і выдаленымі рэгіёнамі, але аказалася, што яе няма.

- Як змяняецца суадносіны колькасці узораў з «амікранам» і «дэльтай», калі ўзяць мінулыя паўтара месяца?

- Калі мы сыходзілі на навагоднія вакацыі, у нас была паўсюдная «дэльта». Калі мы вярнуліся з навагодніх канікул, то ўбачылі паўсюднае дамінаванне "амікрона". Але "дэльта" не сышла цалкам, яна засталася. І суадносіны паміж «дэльтай» і «амікранам» прыкладна аднолькавыя ва ўсіх рэгіёнах на працягу цэлага месяца пасля навагодніх канікул.

- Атрымліваецца, "амікрон" не выцясняе "дэльту"?

- Да канца ён яе не выцесніў. Мы бачым прыкладна 70%-80% "амікрона" і прыкладна 20% "дэльты". Ужо месяц суадносіны "амікрона" і "дэльты" у папуляцыі застаецца аднолькавым. Нельга сказаць, што "дэльта" сыходзіць.

- Колькі отсеквенированных вамі «амікронаў» належыць лініі ВА.1?

- Прыкладна 95%. І 5% - гэта другая лінія. Трэцюю мы не знаходзілі.

- І колькасць «амікронаў» другой лініі таксама застаецца аднолькавым? Нельга зрабіць выснову, што ВА.2-«амікрон» больш заразны?

- Пакуль нельга. Мы бачым генетычныя адрозненні, але прысутнасць BA.2 не нарастае. І па клініцы другая лінія асабліва не адрозніваецца.

- Некаторы час таму была публікацыя кіпрскіх навукоўцаў, якія выявілі рэкамбінант «дэльтакрон». Вы назіралі такіх мутантаў?

- Сапраўды, такая публікацыя была, але неўзабаве пасля яе выхаду з'явіліся каментары аб тым, што гэта магла быць кантамінацыя (забруджванне). Паколькі мы назіраем адначасовую цыркуляцыю "амікрона" і "дэльты", я думаю, што навукоўцы сапраўды маглі прыняць змешаную папуляцыю за рэкамбінант.

«Амікрон» і «дэльта» абароняць адзін ад аднаго досыць далёка. Па сваім паходжанні гэта паралельныя лініі.

З улікам таго, што з'явілася ўсяго толькі адна навуковая публікацыя і больш пытанне існавання "дэльтакрона" не ўзнімалася, хутчэй за ўсё, гэта памылка.

- Вы атрымліваеце вірусы для секвеніравання з мазкоў?

— Так, выключна назафарынгеальныя мазкі. Яны збіраюцца ў розных рэгіёнах Расіі ад пацыентаў. Потым на месцы іх тэстуюць, адказваючы на ​​пытанне: ці сапраўды гэтыя мазкі ўтрымліваюць мэтавы вірус - у дадзеным выпадку каранавірус? Потым ужо спробы дастаўляюць нам спецыяльнымі транспартнымі кампаніямі для паглыбленага тэсціравання.

- Колькі проб змяшчаецца ў секвенатар, калі мець на ўвазе адну партыю? Колькі па часе адбываецца секвеніраванне?

- Як правіла, мы загружаем каля 400-600 проб кожны дзень. Бо ў нас даволі магутны секвенатар PromethION Oxford Nanopore, мы працуем на трэцім пакаленні, то ён гэтыя 600 узораў чытае гадзін 8/9. Уначы чытае, раніцай здымаем, і наступная загрузка. У ім 24 ячэйкі, у кожную змяшчаецца па 96 узораў.

- Вы іх секвеніруеце, а што далей?

- Далей мы ўсе геномныя сіквенсы закладваем у расійскую базу VGARus. Яна функцыянуе ў Расспажыўнаглядзе з чэрвеня 2021 года. Гэтая база ўвесь час запаўняецца, яе дадзеныя можна аналізаваць, глядзець нейкія заканамернасці па зменлівасці віруса. Туды ж падгружаюцца дадзеныя па пацыентах.

- Вы вывучалі мікрабіёмы, таму вас асабліва хочацца распытаць аб пнеўманіі, якая часта ідзе за заражэннем SARS-CoV-2. Адны лекары кажуць, што пры COVID-19 нярэдка да віруснай далучаецца бактэрыяльная пнеўманія. Іншыя лекары, наадварот, лічаць, што далучэнне такога кшталту адбываецца не часта і таму не прапісваюць антыбіётыкі. Што назіраеце вы?

- Варта адрозніваць вірусны пнеўманіі (ці альвеаліт) і ўласна пнеўманію - запаленне, выкліканае бактэрыяльнай інфекцыяй. У цяжкіх выпадках бактэрыяльная інфекцыя далучаецца да гэтага самага пнеўманіту або альвеаліту. Гэта значыць тая пнеўманія, якая з'яўляецца ўскладненнем каранавіруснай інфекцыі, - гэта ўжо не вірусная пнеўманія. Яна заўсёды бактэрыяльная.

- А якія бактэрыі далучаюцца звычайна?- Тыя ж самыя бактэрыі, якія традыцыйна выклікаюць шпітальную пнеўманію. Гэты спіс ва ўсім свеце прыкладна аднолькавы. Гэта, як правіла, Acinetobacter - розныя, пераважна Acinetobacter baumannii, сінегнойную палачка, Pseudomonas aeruginosa, гэта Klebsiella pneumoniae, стафілакокі. Большасць гэтых узбуджальнікаў паходзяць ад глебавых бактэрый, ад якіх яны захавалі здольнасць выжываць у месцах агульнага карыстання, на ўнітазах, на ракавінах, на іншых паверхнях. Часта далучэнню бактэрыяльнай шпітальнай інфекцыі спрыяе кіслародатэрапія.

- Чаму гэта адбываецца?

- Як толькі вы ўключаеце любую прымусовую вентыляцыю лёгкіх, а падача кіслароду - гэта прымусовая вентыляцыя, вы спрыяеце абмену бактэрыяльнай флорай паміж верхнімі і ніжнімі дыхальнымі шляхамі.

У роце і носе чалавека заўсёды шмат бактэрый. Але слізістая выконвае бар'ерную функцыю, яна абсарбуе на сябе мікраарганізмы ў нармальным стане. Пры выкарыстанні кіслародатэрапіі вы воляй-прымусам струменем паветра заносіце бактэрыі і носа, і рота ў трахею і лёгкія.

- Як хутка каранавірусы выпрацоўваюць ўстойлівасць да прэпаратаў на аснове моноклональных антыцелаў?

- Гэта прэпараты накіраванага дзеянні. У гэтым іх плюс і мінус. Монакланальныя антыцелы падбіраюцца да вызначанага тыпу віруса. І таму зусім не факт, што монакланальныя антыцелы, якія выдатна працуюць, напрыклад, супраць штаму "дэльта", будуць працаваць супраць "амікрона". Праблема моноклональных антыцелаў менавіта ў гэтым - яны вельмі спецыфічныя.

bbabo.Net