Seit einem Monat zeigen Proben, die aus allen Regionen Russlands an das Disinfectology Research Institute of Rospotrebnadzor geliefert wurden, das gleiche Verhältnis von Delta- und Omicron-Stämmen. Dies wurde in einem Interview von der leitenden Forscherin des Forschungsinstituts für Desinfektion von Rospotrebnadzor, dem korrespondierenden Mitglied der Russischen Akademie der Wissenschaften, Elena Ilyina, mitgeteilt. Sie erklärte, warum die Sauerstofftherapie zur Entwicklung einer nosokomialen Pneumonie beiträgt, und bewertete die Wirksamkeit von Medikamenten gegen COVID-19. – Elena Nikolaevna, Sie arbeiten am Forschungsinstitut für Desinfektionsmedizin von Rospotrebnadzor und beschäftigen sich mit dem Lesen der Genome von derzeit zirkulierenden Coronaviren. Wie viele Virenproben werden pro Woche, pro Monat sequenziert?

— Wir haben die Kapazität von 2.000 Genome pro Woche erreicht. Und es gibt viele solcher Organisationen, die aktiv sequenzieren. Daher gibt es jetzt in der russischen Datenbank bereits etwa 14.000 Omicron-Genome, und die Gesamtzahl der Coronavirus-Proben beträgt etwa 90.000.Wir sehen sowohl „Omicrons“ der BA.1-Linie als auch eine kleine Menge BA.2. Proben kommen aus allen Regionen.

Deshalb kann man nicht sagen, dass „eine Welle kommt“ über Russland. Es ist eher ein allgemeiner Blitz, ungefähr gleich von allen Seiten. Ich hatte erwartet, einen Unterschied zwischen Moskau und abgelegenen Regionen zu sehen, aber es stellte sich heraus, dass es keinen gab.

- Wie verändert sich das Verhältnis der Probenanzahl mit „omicron“ und „delta“, wenn wir die letzten anderthalb Monate nehmen?

- Als wir in die Neujahrsferien fuhren, hatten wir ein allgegenwärtiges "Delta". Als wir aus den Neujahrsferien zurückkehrten, sahen wir die weit verbreitete Dominanz des "Omicron". Aber das „Delta“ ist nicht ganz verschwunden, es ist geblieben. Und das Verhältnis zwischen "Delta" und "Omicron" ist nach den Neujahrsferien einen ganzen Monat lang in allen Regionen ungefähr gleich.

- Es stellt sich heraus, dass "Omicron" das "Delta" nicht verdrängt?

„Er hat sie bis zum Schluss nicht rausgeschubst. Wir sehen ungefähr 70% -80% "Omicron" und ungefähr 20% "Delta". Seit einem Monat ist das Verhältnis von "Omicron" und "Delta" in der Bevölkerung gleich geblieben. Man kann nicht sagen, dass das "Delta" geht.

- Wie viele von Ihnen sequenzierte „Omicrons“ gehören zur BA.1-Linie?

- Ungefähr 95 %. Und 5% ist die zweite Zeile. Den dritten haben wir nicht gefunden.

- Und die Anzahl der "Mikrometer" der zweiten Zeile bleibt auch gleich? Können wir nicht schlussfolgern, dass BA.2-„omicron“ ansteckender ist?

- Noch nicht. Wir sehen genetische Unterschiede, aber das Vorhandensein von BA.2 nimmt nicht zu. Und in der Klinik ist die zweite Linie nicht besonders unterschiedlich.

- Vor einiger Zeit gab es eine Veröffentlichung von zypriotischen Wissenschaftlern, die das rekombinante „Deltacron“ entdeckten. Haben Sie solche Mutanten gesehen?

- Tatsächlich gab es eine solche Veröffentlichung, aber bald nach ihrer Veröffentlichung tauchten Kommentare auf, dass es sich um eine Kontamination (Kontamination) handeln könnte. Da wir die gleichzeitige Zirkulation von „Omicron“ und „Delta“ sehen, denke ich, dass die Wissenschaftler die gemischte Population tatsächlich mit der Rekombinante verwechselt haben könnten.

Omicron und Delta sind ziemlich weit voneinander entfernt. Von ihrem Ursprung her sind dies parallele Linien.

Angesichts der Tatsache, dass es nur eine wissenschaftliche Veröffentlichung gab und die Frage nach der Existenz des "deltacron" nicht gestellt wurde, ist dies höchstwahrscheinlich ein Fehler.

— Gewinnen Sie Viren zur Sequenzierung aus Abstrichen?

- Ja, ausschließlich Nasen-Rachen-Abstriche. Sie werden in verschiedenen Regionen Russlands von Patienten gesammelt. Dann werden sie vor Ort getestet und beantworten die Frage: Enthalten diese Abstriche wirklich das Zielvirus – in diesem Fall das Coronavirus? Anschließend werden die Proben von speziellen Transportunternehmen zur eingehenden Prüfung zu uns geliefert.

- Wie viele Proben passen in den Sequenzer, wenn wir eine Charge meinen? Wie lange dauert die Sequenzierung?

— In der Regel laden wir täglich etwa 400-600 Proben. Da wir einen ziemlich leistungsstarken PromethION Oxford Nanopore-Sequenzer haben, arbeiten wir an der dritten Generation, er liest diese 600 Proben für 8–9 Stunden. Nachts liest er, morgens drehen wir, und der nächste Download. Es hat 24 Zellen, jede enthält 96 Proben.

- Du sequenzierst sie und was dann?

— Dann haben wir alle genomischen Sequenzen in die russische Datenbank VGARus eingegeben. Es ist seit Juni 2021 in Rospotrebnadzor in Betrieb. Diese Datenbank wird ständig gefüllt, ihre Daten können analysiert werden, um einige Muster in der Variabilität des Virus zu sehen. Hier kommen Patientendaten ins Spiel.

- Sie haben sich mit Mikrobiomen beschäftigt, daher möchte ich Sie besonders zur Lungenentzündung befragen, die häufig auf eine Infektion mit SARS-CoV-2 folgt. Einige Ärzte sagen, dass sich bei COVID-19 häufig eine bakterielle Lungenentzündung der viralen anschließt. Andere Ärzte hingegen glauben, dass eine solche Anheftung selten vorkommt und verschreiben daher keine Antibiotika. Was beobachtest du?

- Es lohnt sich, zwischen viraler Pneumonitis (oder Alveolitis) und Lungenentzündung selbst zu unterscheiden - einer Entzündung, die durch eine bakterielle Infektion verursacht wird. In schweren Fällen gesellt sich zu dieser Pneumonitis oder Alveolitis eine bakterielle Infektion hinzu. Das heißt, die Lungenentzündung, die eine Komplikation der Coronavirus-Infektion ist, ist keine virale Lungenentzündung mehr. Es ist immer bakteriell.

- Und welche Bakterien schließen sich gewöhnlich an?„Die gleichen Bakterien, die traditionell im Krankenhaus erworbene Lungenentzündungen verursachen. Diese Liste ist auf der ganzen Welt gleich. Dies sind in der Regel Acinetobacter - anders, hauptsächlich Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Staphylokokken. Die meisten dieser Krankheitserreger stammen von Bodenbakterien ab, von denen sie sich die Fähigkeit erhalten haben, in öffentlichen Bereichen, auf Toiletten, Waschbecken und anderen Oberflächen zu überleben. Die Sauerstofftherapie trägt häufig zur Hinzufügung einer bakteriellen nosokomialen Infektion bei.

- Warum passiert das?

- Sobald Sie eine Zwangsbeatmung der Lunge einschalten und die Sauerstoffzufuhr bei Zwangsbeatmung erfolgt, fördern Sie den Austausch der Bakterienflora zwischen den oberen und unteren Atemwegen.

Im Mund und in der Nase des Menschen befinden sich immer viele Bakterien. Die Schleimhaut erfüllt jedoch eine Barrierefunktion, sie nimmt Mikroorganismen im Normalzustand auf. Bei der Sauerstofftherapie tragen Sie mit dem Luftstrom wohl oder übel Bakterien aus Nase und Mund in die Luftröhre und Lunge.

— Wie schnell entwickeln Coronaviren Resistenzen gegen Medikamente, die auf monoklonalen Antikörpern basieren?

„Das sind zielgerichtete Medikamente. Das ist ihr Plus und Minus. Monoklonale Antikörper sind auf einen bestimmten Virustyp abgestimmt. Und daher ist es keineswegs eine Tatsache, dass monoklonale Antikörper, die beispielsweise gegen den Delta-Stamm hervorragend funktionieren, auch gegen Omicron wirken. Das Problem mit monoklonalen Antikörpern ist genau das – sie sind sehr spezifisch.

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