Le laboratoire de diagnostic clinique DNAOM a étudié les tests PCR positifs pour le coronavirus obtenus dans les bureaux régionaux au cours des six derniers jours et a découvert que la souche delta était inférieure à 3% dans les échantillons. Ainsi, la part de "omicron" en Russie s'est rapprochée de 100%. Selon les statistiques officielles de Rospotrebnadzor, 20% des cas d'infection à Moscou et à Saint-Pétersbourg relèvent encore de la version la plus "sévère" du coronavirus. Pendant ce temps, les Russes veulent de plus savoir quelle souche de COVID-19 ils ont contractée, un service déjà proposé par les grandes chaînes.
Du 27 janvier au 1er février, des tests PCR positifs ont été testés pour la souche de coronavirus dans 87 bureaux du Centre DNAOM de recherche génétique moléculaire dans plus de deux douzaines de régions de Russie. Andrey Isaev, PDG de DNKOM, a précisé que la plupart des échantillons ont été testés à Moscou et dans la région de Moscou : 97 % se sont avérés être « omicron » et seulement 3 % « delta ». En général, la répartition dans le District fédéral central est similaire : 98 % et 2 %, respectivement. Ces données, note M. Isaev, "peuvent être considérées comme représentatives". "Dans d'autres régions, la sélection d'échantillons positifs testés est encore insuffisante, mais déjà maintenant dans les districts fédéraux du Nord-Ouest et de l'Oural, 100% des échantillons testés tombent sur Omicron, dans d'autres régions - 98 à 100%", déclare M. Isaev .
Il précise que le laboratoire détermine la souche à l'aide d'un système de test PCR, qui permet de typer l'infection à l'aide de séquences génétiques spécifiques pour "omicron" et "delta". « Cette technologie est légèrement plus chère que la PCR conventionnelle, mais beaucoup moins chère que le séquençage. Et comme la PCR est, en principe, une méthode de diagnostic très précise, la fiabilité de cette détermination des souches est également de 99,99 %. Le système de test permet de typer l'infection et de collecter des statistiques, mais contrairement au séquençage, il n'est pas conçu pour rechercher et étudier de nouvelles souches », explique M. Isaev.
Les données obtenues, selon Andrey Isaev, nous permettent de conclure qu'Omicron a vaincu le Delta dans toutes les régions de Russie, et cela s'est produit plus rapidement que dans d'autres pays.
Dans le même temps, la recherche DNAOM diffère des statistiques officielles. Mardi, la responsable de Rospotrebnadzor, Anna Popova, a déclaré que 80% des cas d'infection à Moscou et Saint-Pétersbourg sont omicron, tandis que 20% des cas sont toujours associés au delta. Dans ce dernier cas, a souligné Mme Popova, la maladie est grave, affectant les personnes en mauvaise santé. Plus tard, lors d'une réunion du conseil de coordination de la lutte contre le COVID sous le gouvernement de la Fédération de Russie, Mme Popova a précisé que, selon les résultats du séquençage, 15 287 cas d'infection à l'omicron ont été enregistrés dans 83 régions de la Fédération de Russie. Plus tôt, Rospotrebnadzor a expliqué que 5 à 10% des patients de chaque région testent des échantillons biologiques avec de nouveaux systèmes de test, car il n'est «pas nécessaire» d'analyser tous les échantillons positifs.
Le biologiste moléculaire, chercheur à l'Université d'État de Moscou, Sergei Kharitonov, explique la différence entre les données de Rospotrebnadzor et d'un laboratoire privé comme suit : « Lorsque nous avons plus de 100 000 personnes infectées par jour, il est clair que la situation change constamment. Peut-être que DNACOM a des informations plus récentes. M. Kharitonov souligne que les experts s'attendaient à un tel développement des événements : différentes souches de coronavirus sont en concurrence féroce les unes avec les autres pour une ressource, c'est-à-dire pour une personne, de sorte que la variante qui se transmet plus rapidement remplace rapidement ses prédécesseurs. L'épidémiologiste Anton Barchuk n'exclut pas que le "delta" se propage encore dans certains groupes (par exemple, parmi les non vaccinés et les guéris), et "ne s'appuierait pas" sur les données d'un seul réseau. Cependant, il souligne que la plupart des appels à un laboratoire privé peuvent en effet être liés au "omicron" en raison de sa prévalence.
Notez que ce n'est qu'avec l'avènement de cette variante du coronavirus que des centres privés de recherche en génétique moléculaire ont commencé à offrir le service de détermination de la souche. Le laboratoire Gemotest a notamment introduit une telle option le 17 janvier. Selon le directeur des technologies de laboratoire, docteur en diagnostic de laboratoire clinique Tamara Silkina, en deux semaines, la demande pour ce type de test s'est élevée à 9,5% de tous les tests PCR pour COVID-19. Ceci, selon Mme Silkina, est plus probablement dû au désir des patients de connaître leur diagnostic avec plus de précision. Cependant, souligne-t-elle, pour les médecins, les informations sur une souche particulière ne sont pas cliniquement significatives pour déterminer les tactiques de traitement.
Anton Barchuk est convaincu qu'avec l'avènement de «omicron», le sens du test disparaîtra progressivement: «La tâche principale du test dans les premiers stades d'une pandémie est de retrouver les contacts, d'isoler les personnes afin que l'infection ne se propage pas davantage. A la vitesse à laquelle l'omicron se propage, cela n'est plus d'actualité. »Cependant, le Premier ministre russe Mikhail Mishustin a exhorté mercredi les membres du conseil de coordination pour lutter contre le coronavirus à ne pas ralentir le rythme des tests et a déclaré que le gouvernement allouerait environ 400 millions de roubles. pour une étude plus approfondie des souches circulantes de coronavirus et le séquençage de leur génome. L'inquiétude du gouvernement est liée aux dernières données de rapport : Anna Popova a déclaré que l'incidence du COVID-19 en Russie a doublé au cours de la semaine et est déjà de 468,5 pour 100 000 habitants (mercredi, le siège opérationnel fédéral a signalé 141 883 nouveaux cas de coronavirus). Le ministre de la Santé, Mikhail Murashko, a ajouté que la part des hospitalisations avait également augmenté - de 23 % par semaine. Il y a actuellement 147 000 patients atteints de coronavirus dans les hôpitaux, 11 % de la maladie est grave. Par ailleurs, le ministre a noté que les cas d'hospitalisations et les cas graves de COVID-19 chez les enfants sont en augmentation. Pour cette raison, le nombre de lits dans les hôpitaux pour enfants a été multiplié par une fois et demie, à 11 385. Parmi ceux-ci, près de 10 000 sont occupés.
Dans le même temps, les autorités de Moscou s'attendent cette semaine à "atteindre un plateau", a déclaré le maire Sergueï Sobianine. Selon lui, le nombre de cas d'infection à coronavirus dans la capitale a augmenté de près de 70 % au cours de la semaine, les hospitalisations - de 40 %. Dans le même temps, la dynamique de l'augmentation de l'incidence à Moscou diminue et on espère que "la situation dans la ville se stabilisera".
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