Исследователи из Университета Кипра на прошлой неделе сообщили о новом штамме коронавируса, который оказался гибридом вариантов Дельта и Омикрон.

Но позже возникли сомнения в отношении гибрида «Дельтакрон» — некоторые связывали это с ошибкой данных во время секвенирования генома — и последовательности были изъяты из базы данных геномной информации с открытым исходным кодом.

Но стоит ли нам беспокоиться о перспективах появления таких гибридных штаммов в будущем?

Леондиос Кострикис, профессор биологических наук в университете, сообщил Bloomberg в минувшие выходные, что его команда обнаружила 25 пациентов, инфицированных штаммом коронавируса с омикрон-подобными генетическими сигнатурами в геномах дельты. Данные секвенирования генома были загружены в базу данных с открытым исходным кодом Gisaid.org.

Но другие ученые пришли к выводу, что результаты могут быть результатом лабораторной ошибки: вирусолог Том Пикок из Имперского колледжа Лондона написал в Твиттере, что это выглядело «совершенно явно как заражение», а не реальная рекомбинация.

По словам Пикока, конкретная область последовательностей с мутациями, подобными Omicron, имеет тенденцию «выпадать» в процессе секвенирования, и пробел может быть случайно заменен фрагментами Omicron, которые были амплифицированы и привели к гибридным геномам.

Он добавил, что на самом деле это не было связано с «качеством лаборатории» или чем-то подобным, и такие ошибки время от времени случаются в каждой лаборатории секвенирования.

Мария Ван Керхове, технический руководитель Всемирной организации здравоохранения по Covid-19, стремилась воспрепятствовать использованию таких терминов, как Deltacron, flurona или flurone, причем последний относится к коинфекции гриппа.

«Эти слова подразумевают сочетание вирусов и вариантов, а этого не происходит. «Дельтакрон», вероятно, был заражен во время секвенирования», — написала она в Twitter.

Да, возможна рекомбинация различных вариантов.

Бьорн Мейер, вирусолог из Университета Отто фон Герике в Магдебурге в Германии, сказал, что путем рекомбинации двух вирусных геномов, поражающих одну и ту же клетку, вирусы могут удалять мутации, которые могут оказать негативное влияние.

«Поэтому в некотором роде это своего рода геномное обслуживание вирусных популяций», — сказал Мейер.

Он сказал, что геном полученного рекомбинантного вируса должен был соответствовать порядку родительских вирусов, процесс, называемый «гомологичной рекомбинацией», чтобы обеспечить полностью функциональный вирус.

Исследователи из Национального института инфекционных заболеваний в Японии в октябре опубликовали нерецензируемую статью, в которой сообщалось о геномной рекомбинации между вариантами дельта и альфа в образцах 26 пациентов с Sars-CoV-2 в Японии.

А в статье, опубликованной в Cell в сентябре, исследователи из Университета Эдинбурга, Университета штата Пенсильвания и других учреждений заявили, что 16 геномов из примерно 279 000, которые они проанализировали, показали признаки рекомбинации.

Геномы в основном находились между вариантом Alpha и вариантами B.1.177, о которых впервые сообщили в Испании летом 2020 года. Перед исчезновением он был передан 45 людям.

«Только при определенных обстоятельствах рекомбинантный вариант показал преимущество в росте у людей, у которых есть антитела против Sars-CoV-2», — сказал он, имея в виду вирус, вызывающий Covid-19. «В противном случае эти рекомбинантные варианты не станут доминирующими и просто исчезнут».

Вариант Омикрон имеет мутации шиповидного белка, который играет ключевую роль в заражении клеток человека, и это позволяет Омикрону легче уклоняться от иммунитета от инфекции или вакцинации.

По словам Мейера, некоторые мутации также были ответственны за потенциальное изменение путей проникновения вируса, что может объяснить снижение тяжести наблюдаемого заболевания.«Может произойти рекомбинация этих двух вирусов, но сгенерированный новый рекомбинант, вероятно, приведет к появлению вируса, который ведет себя как Омикрон, который может в некоторой степени уклоняться от наших антител, но вызывает менее тяжелое заболевание у вакцинированных людей», — сказал Мейер.

«Или это будет похоже на Дельту, которая может вызвать более тяжелое заболевание, также более вероятное у непривитых людей, но легче распознаваемое у вакцинированных или ранее инфицированных людей и, как следствие, не вызывающее серьезного заболевания».

bbabo.Net