Za sev omikron smo prvič slišali konec novembra 2021, ko so bile prve sekvence genoma koronavirusa SARS-CoV-2, pridobljene s sekvenciranjem vzorcev bolnikov iz Južne Afrike in Bocvane, naložene v mednarodno bazo podatkov GISAID. Pozornost znanstvenikov so pritegnili z zelo velikim številom mutacij, predvsem v genu spike proteina, in že takrat so posumili, da bi lahko imela taka varianta virusa kakšne posebne lastnosti.
Prej smo odkrili vsaj delček omikronskih mutacij v drugih pomembnih sevih - enakih "alfa", "beta" ali "delta", vendar jih še nikoli nismo videli toliko naenkrat v enem genomu in iz tega so neprijetne napovedi sledili glede morebitne povečane prenosljivosti virusa, pa tudi zmožnosti obhoda imunske obrambe. Dejansko je število prenesenih zaporedij omikronskega genoma v mednarodni bazi podatkov zelo hitro raslo, prav tako število primerov v Južni Afriki, kmalu zatem pa so ga začeli najti tudi v drugih državah in skoraj nadomestili delta varianto v večini regij planet. Pod prvim udarcem so padle tiste države, ki so imele aktivno letalsko povezavo z državami Južne Afrike, na primer z Veliko Britanijo. Vendar pa imajo tudi prvi začeli upadati incidenca. Slednje je drugim državam omogočilo napovedovanje epidemiološke situacije na svojem ozemlju. Toda tako ali drugače je zdaj "omicron" vseprisoten, čeprav ni dejstvo, da bo zaradi oslabljene navzkrižne imunosti popolnoma izpodrinil "delto".
Novi sev se je dejansko izkazal za veliko bolj nalezljivega od vseh prejšnjih sevov, poleg tega pa je lahko delno obšel imunsko obrambo tako tistih, ki so bili prej bolni, kot tudi cepljenih, zlasti tistih, ki so bili bolni. ali že zdavnaj cepljeni./i
Vendar pa je še vedno vredno rezervirati tukaj. Pogosto naveden blag potek bolezni ob okužbi z "omikronom" ni nujno le lastnost najnovejšega seva. Pravzaprav je v večini držav sveta velika večina prebivalstva tako ali drugače že cepljena. Nekje je bilo to doseženo s pomočjo aktivnega programa cepljenja, nekje, kot na primer v Južni Afriki, je bil odstotek obolelih zelo visok (po neuradnih podatkih do 80-90 % prebivalstva države). bili bolni), na splošno pa so mnogi že zboleli in so bili cepljeni, ti pa imajo zdaj najmočnejšo zaščito pred virusom. Če bi se "omicron" pojavil leta 2020, bi lahko bile posledice podobne posnetkom iz grozljivke. Zato se resnična smrtnost tega seva preprosto ne kaže več - okolje se je spremenilo.
Omeniti velja tudi, da je povečanje števila hospitalizacij otrok po svetu morda posledica dejstva, da ta skupina večinoma ni bila cepljena, poleg tega pa so bili otroci delno imuni na druge seve, vsaj virus je bil veliko bolj zapleteno od njih. Zato je prav ta skupina ostala ena najbolj neobrambnih pred "omikronom". Na splošno je nazoren primer koristi cepljenja.
Ob tem naj vas spomnim, da je pred »omikronom« na vso moč divjala »delta«, ki je povzročila porast obolevnosti in smrti po vsem svetu. V Indiji je bilo maja 2021 uradno odkritih do 400 tisoč novih bolnikov na dan, razmere v bolnišnicah pa so bile preprosto katastrofalne. Zdaj v Indiji, na »omikronu«, čeprav so številke obolelih in smrtnih izidov visoke, so še vedno bistveno nižje kot v »delti«, kar kaže tudi na povečanje deleža imunskega sloja med prebivalstvom in določen prehod pandemije v status endemične. Le da je bilo to nekje doseženo s pomočjo cepljenja, nekje pa - z visoko ceno za zdravje in življenje ljudi. In pogosto, vsaj v razvitih državah, ki imajo svoja cepiva, je prebivalstvo izbralo svojo pot za zaščito pred virusom.
Kar zadeva različne podrazličice, je bila ista "delta" razdeljena na veliko število podvrstic, ki pa se med seboj po lastnostih niso veliko razlikovale in le redko je ena začela prekašati druge. Toda hkrati je prišlo do razslojevanja številnih delta črt na posamezne države. Nekateri, vključno z Rusijo, so imeli svoje prevladujoče podvrste. Mnogi so tudi verjeli, da bo "delta" postala zadnja veja evolucije koronavirusa in potem bomo videli le nekaj manjših izboljšav patogena. Vendar nas je virus spet prevaral in se pojavil v novi preobleki »omikrona«.Zdaj prevladujoči seva, znan kot BA.1, je odgovoren za ogromno število potrjenih novih primerov koronavirusa po vsem svetu. Po podatkih WHO je 31. januarja 2022 BA.1 predstavljal 96,4 % zaporedij, naloženih v GISAID. Vendar pa jo je v nekaterih regijah že začela izpodrivati druga podrazličica, znana kot BA.2, ki se od BA.1 razlikuje po nekaj ducatih mutacij. Hkrati nekateri strokovnjaki upravičeno menijo, da BA.2 ni potomec BA.1, temveč neka samostojna veja, ki bi lahko, kot pravijo, nastala iz istega pacienta v Južni Afriki, ki je rodila do »omikrona«, čeprav ostaja vprašanje izvora slednjega odprto. Zato se BA.2 pogosto ne omenja kot hčerka, temveč kot »sestrska« podvrsta BA.1. Porazdelitev BA.2 se zdaj natančno spremlja v mnogih državah, vključno z Dansko, Indijo in Nepalom, kjer je ta linija postala prevladujoča, zato poznamo nekatere edinstvene lastnosti podvrste.
BA.2 so imenovali tudi "neviden", ker nima genetskega izbrisa dveh aminokislin v beljakovini spike, delu virusa, ki mu pomaga pri vstopu v človeške celice. Pravzaprav so to mutacijo uporabili številni tuji testi PCR, da bi odkrili sev Omicron, ki ga je razlikoval od seva Delta. In potem se je izkazalo, da je tako rekoč "omicron", vendar ni izbrisa, zato so testi zgrešili. Treba je reči, da je zaporedje virusnega genoma zagotovljeno, da odkrije vse spremembe v nukleotidnem zaporedju patogena, v tem primeru pa so napake praktično izključene. Poleg tega doslej ni bilo ugotovljene razlike v resnosti poteka bolezni, ki jo povzročata dve podrazličici omikrona. In ločeno odprto vprašanje je, ali se je mogoče okužiti z BA.2 po BA.1 in obratno. Doslej takih primerov ni bilo dokumentirano.
Vendar pa povečana prenosljivost BA.2 pomeni, da bi lahko postal prevladujoči sev po vsem svetu, lahko pa tudi izgine, če ga izpodrine druga različica ali se sooči z učinkovitimi protiukrepi.
Zaradi tega se je delo na preučevanju genomov novega koronavirusa trenutno močno okrepilo, število prenesenih genomskih zaporedij v bazi podatkov VGARus hitro raste in zdaj znaša skoraj 90.000 zapisov, od tega tretjina bo leta 2022. Zdaj je v bazi podatkov več kot 14 tisoč zaporedij "omicron", od tega je BA.2 približno 500. Primeri okužbe s tretjo vrstico "omicron" BA.3, ki ima tudi svoje razlike in ni razširjena. uporabljajo v svetu, v Ruski federaciji niso opazili.
bbabo.Net