Вперше про омікрон-штам ми почули наприкінці листопада 2021 року, коли до міжнародної бази даних GISAID було завантажено перші послідовності геному коронавірусу SARS-CoV-2, отримані секвенуванням зразків від пацієнтів з ПАР та Ботсвани. Вони привернули до себе увагу вчених дуже великою кількістю мутацій, особливо в гені спайкового білка, і вже тоді запідозрили, що такий варіант вірусу може мати якісь особливі властивості.
Принаймні частку мутацій омікрону ми раніше детектували і в інших значущих штамах - тій же "альфе", "беті" або "дельті", але ніколи не бачили їх стільки відразу в одному геномі, і з цього і випливали неприємні прогнози щодо можливої підвищеної трансмісивності вірусу, а також уміння обходити імунний захист. І дійсно, кількість завантажених послідовностей геному омікрону в міжнародній базі даних дуже швидко зростала, як і кількість хворих у Південній Африці, і незабаром після цього він став виявлятися і в інших країнах, практично витіснявши варіант «дельта» у більшості регіонів планети. Під перший удар потрапили ті країни, які мали налагоджене активне авіасполучення з країнами Південної Африки – наприклад, Великобританія. Втім, у них у перших почався і спад захворюваності. Останнє дало можливість решті країн прогнозувати епідситуацію на своїх територіях. Але так чи інакше зараз «омікрон» поширений повсюдно, хоча не факт, що він повністю витіснить «дельту» через ослаблений перехресний імунітет.
Сам новий штам справді виявився набагато заразнішим, ніж усі попередні штами, і, крім того, умів частково обходити імунний захист як у перехворілих раніше, так і у вакцинованих – особливо тих, хто хворів або поставив щеплення давно./i
Втім, тут все ж таки варто відразу обмовитися. Часто згадуваний легкий перебіг захворювання при інфікуванні «омікроном» необов'язково виступає лише властивістю нового штаму. Насправді, у більшості країн світу переважна частина населення так чи інакше вже імунізувалася. Десь цього домоглися за допомогою активної програми вакцинації, десь, як, наприклад, у ПАР, дуже високий відсоток перехворіли (за неофіційними даними, перехворіли до 80-90% населення країни), а взагалі багато хто вже й перехворів, і був вакциновані, і такі зараз – найсильніший захист проти вірусу. Якби «омікрон» з'явився у 2020 році, то наслідки могли б бути схожими на кадри з фільму жахів. Тому справжня летальність цього штаму вже не виявляється – змінилося оточення.
При цьому, нагадаю, до «омікрону» бушувала «дельта», яка викликала підйоми захворюваності та летальних наслідків у всьому світі. У тій же Індії у травні 2021 року тільки офіційно щодня виявлялося до 400 тисяч нових хворих, і ситуація в лікарнях була просто катастрофічною. Зараз в Індії на «омікроні» цифри за хворими і летальними наслідками хоч і високі, але все ж таки істотно нижчі, ніж при «дельті», що також показує збільшення частки імунного прошарку серед населення і якийсь перехід пандемії в статус ендемії. Просто десь цього досягли за допомогою вакцинації, а десь – високою ціною здоров'я та життів людей. І найчастіше, принаймні в розвинених країнах, які мають свої власні вакцини, саме населення самостійно обирало свій шлях набуття захисту проти вірусу.
BA.2 також був названий «невидимкою», тому що в ньому відсутня генетична делеція двох амінокислот у шиповидному білку – частини вірусу, що допомагає проникнути в клітини людини. Власне, ця мутація і використовувалася багатьма зарубіжними тестами ПЛР для того, щоб детектувати штам «омікрон», відрізняючи його від «дельти». А тут вийшло, що ніби і «омікрон», але делеції немає, і тому тести промахувалися. Варто сказати, що секвенування геному вірусу при цьому гарантовано виявляє всі зміни в нуклеотидній послідовності патогену, і в такому разі помилки виключені. Крім того, поки що так і не було виявлено відмінностей у тяжкості перебігу захворювання, спричиненого двома підваріантами «омікрону». І окреме відкрите питання – чи можна заразитися BA.2 після BA.1, і навпаки. Поки що таких достовірних випадків не задокументовано.
Однак підвищена трансмісивність BA.2 означає, що він може стати домінуючим штамом у всьому світі, але він також може і зникнути, якщо його витіснить інший варіант або він зіткнеться з ефективними заходами протидії.
У тому числі з цього моменту істотно активізована робота з вивчення геномів нового коронавірусу, й у базі даних VGARus швидко зростає кількість завантажених геномних послідовностей, становлячи нині майже 90 тисяч записів, їх третину – 2022 року. Зараз послідовностей «омікрону» в базі понад 14 тисяч, з яких BA.2 – близько 500. Випадків інфікування третьою лінією «омікрону» BA.3, яка також має свої відмінності і не набула широкого поширення у світі, в РФ не відзначено.
bbabo.Net